В 1997 году был создан медицинский центр «ИнтерГоспиталь» при Кыргызском государственном национальном университете, и его директором стал Исманкулов. В 1998 году он заключил контракт с корейской компанией на поставку медицинского оборудования в Кыргызстан. Однако, по версии следствия, Исманкулов организовал коррупционную схему, в рамках которой государственная доля университета была выведена в частную собственность через фиктивные собрания учредителей.
С 1999 по 2000 годы в страну поступило медицинское оборудование на сумму свыше 9 миллионов долларов США. Однако, согласно следствию, это оборудование было незаконно распределено между частными клиниками, принадлежащими Исманкулову, а кредит на его закупку до сих пор не погашен. На сегодняшний день сумма долга составляет 31 миллион долларов США.
Исманкулов был задержан по подозрению в коррупции, и суд избрал в отношении него меру пресечения в виде заключения под стражу. В настоящее время продолжаются следственные действия для выявления всех причастных к данному делу.
